农副产品加工业是巴州“一区一中心一枢纽五基地”定位中非常重要的产业之一，也是开发区重点打造的“五基地”之一，2011年8月，农副产品加工园被国家农业部批准为国家第一批农业产业化示范基地，自批准以来有力地推动了当地农业产业化经营快速稳健的发展。
“十三五”期间，园区始终按照“扶龙头、壮基地、兴特色、保增收”的工作思路,不断加强龙头企业、农产品基地、经营体系、合作经济组织和农产品品牌建设，积极推进农业结构战略性调整，有力推动了农业产业化快速、稳定、健康发展，重点推进粮油加工、奶制品加工、啤酒加工及果品冷链仓储建设。目前全园区现有农产品加工企业58家，农业产业化重点龙头企业17加，年销售收入2000万元以上的企业有21家，收入上亿元的企业有13家，2020年，园区农产品加工企业预计实现产值87亿元，较2015年同比增长42.6%。
一是产业链不断完善，由面粉、粮油初加工如孔雀河国家粮食储备有限公司、众恒油脂有限公司、同丰油脂工贸有限责任公司等，到主食加工如中聚粮油有限公司、凯瑞可食品科技有限公司等，不断完善粮油加工产业链，由鲜果冷藏如金丰利冷藏、果荟农产品等，到林果精深加工如黑果枸杞等，不断完善果品产业链；二是品牌效应逐步提升，凯瑞可食品科技有限公司鲜奶、奶酪、奶酒等奶制品综合加工循环经济项目建设完成，全线日处理30吨鲜奶，已相继获得国家高新技术企业、国家绿色工厂认定，获批自治区专精特新“小巨人”培育企业名单，乌苏啤酒（库尔勒）有限公司二期年产10万吨啤酒生产线项目建成运行；三是配套物流体系快速形成，以金丰利冷藏、果荟农产品为龙头的果品仓储企业已建成仓储总量达到21万吨，成为西北地区最大的冷链物流园区，为园区农副产品物流配送提供保障。
开发区要以主导产业结构升级为根本，以创新平台驱动为主线、以区域协同发展为依托、以绿色生态建设为导向、以体制机制改革为引领，持续推动开发区高质量运行。“十四五”农副产品精深加工业预计实现产值100亿元，投资约25亿元，建立“三集群一高地”：围绕香梨、白杏、红枣、葡萄、黑枸杞、番茄、辣椒七大特色林果产业，以天然健康为导向，培育一批研发投入大、技术水平高、综合效益好的龙头企业、农业创新型企业，推动林果加工产业链向以休闲零食为主的健康食品，以乳制品、纯果汁、果酒为主的健康饮品，以植物提取物为主的医药保健品方向延伸，建设成为全疆主要、西部重要的食品加工集群、饮品加工集群、医药保健品加工集群；通过与重点科研院所合作，提升特色林果加工研发技术水平，全面实现科技成果在农副产品精深加工产业园内的转化、应用和示范，建设成为西北重要的特色林果加工研发高地。
2021年是“十四五”的开局之年，对推进农产品加工业迈向高质量发展具有非常重要的意义，我们要以创新为引擎，着力推动产业升级，要以企业为依托，提升园区活力。
提升发展理念，优化产业布局。农副产品加工业作为开发区的特色产业，要以提质增效为核心，坚持从数量增长向质量提升、从分散布局向集群发展、从单链发展向产业融合转变，高位谋划、高位推动，充分发挥巴州地区的生态农产品优势，与周边园区优势互补、错位布局、协同发展，共建农副产品精深加工产业园。同时整合现有资源，推进优势产业和优势企业向优势区域集聚，打造以食品加工集群、饮品加工集群、医药保健品加工集群为主的影响力大、带动性强、优势突出的产业集群。
延伸产业链，提升核心实力。要围绕重点主导产业和龙头企业，实施农产品精深加工“三延三融”发展战略，“三延”即加快推进特色林果产品向食品加工、饮品加工、医药保健品加工三个方向延伸，上下游产业有机衔接，积极培育发展新业态新模式。“三融”即以特色林果加工为主导，实现农副产品精深加工、生物科技、商贸物流产业相融；以农业科技创新为核心，实现农副产品加工研发、品牌营销创新相融；以“联农带农”为贯穿，实现加工企业、周边农户、生产合作社产城相融，建设成为现代农副产品精深加工产业园。
推进产业发展，强化“双高”路径。强化高质量发展路径：重点推进生态农产品及食品饮料加工品的技术研发、冷链运输、网络营销、品牌建设，着力发展一批依托电商平台进行销售、冷链设备进行运输的健康食品、果汁果酒品牌项目， 联合中国农业科学院郑州果树研究所、新疆农垦科学院等科研院所合 作设立林果产业研究院，组建品种研发、果品检测、加工技术等研究 实验室，打造“林果加工产业集群 农业创新高地”；强化高附加值发展路径：重点推进生态农产品向植物提取物生产方向发展，着力发 展一批生物科技、精细化工、制药企业，进一步延伸天然色素、香精 香料、食品添加剂、医药中间体等高附加值产业链，推进农产品精深 加工产业、精细化工产业、生物科技产业协同发展的目标。
强化科技创新，加快转型升级。根据香梨、红枣等特色农产 品的特点及市场需求，引导一批有自主知识产权的农业高等院校、科研院所、生物科技企业聚集，对标农业高新技术产业示范区的标准，完善各类研发机构、测试检测中心、新农村发展研究院、现代农业产业科技创新中心等创新服务平台。探索研发与应用无缝对接的有效办法，支持科技成果在区内转化、应用和示范。同时，依托研究机构设立具有区域特点的农民培训基地，开展针对种植采摘、精深加工、仓储物流、金融等各个领域的专业化教育，从技术和市场端为农户提供指导与建议。出台相应措施鼓励家庭农场、农民合作社等新型农业经营主体创新创业。